话分两头，博物馆组织最近倒是处于内外交困之中。
近期，受圆咲一家内战的影响，盖亚记忆体大规模流入风都民间，使得许多饱受灾难的市民或主动、或被动使用盖亚记忆体，继而被盖亚记忆体的精神毒素影响，这让风都本就混乱不堪的局势愈加混乱起来。
在这种情况下，圆咲姐妹之间的内战依然没有停歇，反而在圆咲琉兵卫的刻意纵容下，已经毫不掩饰，彻底摆在了明面上，这让博物馆组织的许多干部趁势脱离而出，开启自己的野心争霸之路。
眼见局势在自己的纵容下变得如此混乱，圆咲琉兵卫非但没有进行约束，反而更加认为只有完成最终的计划，才能改变世界，实现理想乡的最终降临。
为此，圆咲琉兵卫一边持续激发着圆咲若菜的斗争意志，一边促使圆咲若菜变身的粘土人偶掺杂体不断经历死亡与重生，加快圆咲若菜对极限力量的融合与掌控，实现最终最后的进化。
徘徊在死亡与重生之间的圆咲若菜，思想与性格愈加病态起来，对极限力量的适应进度也在稳定提升。
在这期间，圆咲若菜成功连接上了地球图书馆，并不断获得地球图书馆的控制权限。
但是，让圆咲若菜想不到的是，她几次进入地球图书馆都始终没见到菲利普。
甚至，有好几次圆咲若菜明明察觉到了菲利普登录进地球图书馆，立马进入地球图书馆，也还是找不到菲利普的身影。
面对这样奇怪的情况，圆咲若菜询问过圆咲琉兵卫，但后者也不清楚是怎么回事，只是提了几点猜想与建议。
按照圆咲琉兵卫的猜想进行了一番验证后，圆咲若菜依然没有找到问题所在，这进一步刺激了圆咲若菜的精神状态，使得圆咲若菜愈发病态起来。
愈发病态的圆咲若菜有试过去找菲利普“叙旧”，或者去找W的麻烦，但都被百鬼或圆咲冴子打断，难以见到菲利普或者是W。
而不知情况的菲利普，则是一边老老实实的向谢拉德学习记忆体技术，一边在谢拉德的帮助下研究骨女记忆体和火焚尸记忆体，偶尔抽空回应左翔太郎的变身请求。
混乱的城市，使得时间过漫长又短暂。
在不间断的死亡与重生中，圆咲若菜成功完成最终的进化，变身成了可以操控大地力量、掌握地球图书馆的地球巫女。
在圆咲若菜完成最终进化之时，所有记忆体、使用记忆体力量的存在都察觉到了圆咲若菜的存在。
其中，以百鬼中的大妖鬼反应最为激烈。
圆咲若菜泄露出来的力量气息，让它们看到另一种希望。
虽然，大妖鬼们也不知道该如何利用这股力量，但先夺取到手，自然有足够的时间可以去研究。
于是，在大妖鬼们的意志下，百鬼暂停了对W的狩猎，转而去狩猎起圆咲若菜。
百鬼的反应，既在圆咲琉兵卫的预料之中，也在圆咲琉兵卫的预料之外。
圆咲琉兵卫预想过百鬼的反应，但他没想到百鬼的实力远在他的设想之外。
或者说，圆咲琉兵卫没想到百鬼也在不断进化，甚至进化速度远超他对盖亚记忆体的了解。
面对百鬼不加掩饰的进攻，还在圆咲琉兵卫掌控下的博物馆成员被打的节节败退。
万幸的是，百鬼的异常也被左翔太郎他们看在眼里，顺带知晓了发生在圆咲若菜身上的事情。
对于圆咲琉兵卫的所作所为，菲利普难以接受，也十分心疼圆咲若菜所遭受的精神折磨。
不过，现实的情况并不容许菲利普他们对圆咲琉兵卫等人做出制裁，当务之急是先阻止百鬼带走圆咲若菜，以防不测。